Hay muchos “Base de Datos como Servicio”. Nosotros ponemos, por ejemplo, Compose.io.
Para hacerlo necesitas los drivers de node-mongodb, que puedes instalar con npm install mongodb
Después ejecutaremos este archivo (lo podemos llamar node.js y en consola simplemente ejecutar js node.js), que hará basicamente un par de inserciones.
Comento algunos parámetros antes: * en la línea 3 el parámetro para la conexión será la Mongo URI, y usuario:usuario serán nombre de usuario y contraseña de un “User” que tengamos en nuestra base de datos * en la línea 5 especificamos la BD
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Una vez ejecutado nos indica que está correctamente conectado e insertado:

y también lo podemos ver en Compose:

Tutoriales de interés:
https://docs.compose.io/languages/nodejs.html
y este muy básico: https://www.digitalocean.com/community/tutorials/how-to-connect-node-js-to-a-mongodb-database-on-a-vps